準(zhǔn)備工作
設(shè)備校準(zhǔn):在開始測序之前,需要對基因測序儀進(jìn)行校準(zhǔn),確保其性能符合標(biāo)準(zhǔn)。
樣本準(zhǔn)備:
DNA提?。簭纳飿颖荆ㄈ缪?、組織等)中提取DNA。
文庫構(gòu)建:將提取的DNA打斷成小片段,然后進(jìn)行末端修復(fù)、加A尾、接頭連接等步驟,構(gòu)建成適合測序的文庫。
樣本質(zhì)量控制:對構(gòu)建好的文庫進(jìn)行定量和質(zhì)控,確保文庫的質(zhì)量。
測序步驟
上機測序:
將合格的文庫樣本添加到測序反應(yīng)體系中。
將反應(yīng)體系加載到測序儀的樣本板(或芯片)上。
測序反應(yīng):
PCR擴增:對文庫樣本進(jìn)行PCR擴增,以增加目標(biāo)區(qū)域的DNA量。
測序:測序儀會逐個讀?。模危疗蔚男蛄行畔?。
測序儀會按照預(yù)定的測序流程進(jìn)行反應(yīng),通常包括以下步驟:
數(shù)據(jù)收集:
測序儀會將測序結(jié)果以圖像或數(shù)據(jù)流的形式輸出。
數(shù)據(jù)分析:
質(zhì)量控制:去除低質(zhì)量序列。
序列拼接:將測序得到的短讀段拼接成長序列。
比對:將拼接后的序列與參考基因組比對,確定變異位點。
變異注釋:對檢測到的變異進(jìn)行功能注釋。
將測序數(shù)據(jù)導(dǎo)入生物信息學(xué)軟件進(jìn)行分析,包括:
后續(xù)操作
結(jié)果解讀:根據(jù)數(shù)據(jù)分析結(jié)果,解讀測序數(shù)據(jù),得出生物學(xué)結(jié)論。
報告生成:將分析結(jié)果整理成報告,供臨床或研究使用。
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